首先必须要了解清楚交警的职责和任务，才好解答这个问题。交通警察，简称交警，是指在公安机关下属机关交通管理局内的人民警察。是人民警察的一个警种，在执勤时有辅警协助工作，其主要职责是维护交通秩序，处理交通事故，查纠道路交通违法行为，负责机动车的登记管理等。
那么现在来回答交警查车时，可不可以搜查车辆的内部和后备箱呢？
根据交警的职责，除了交通违规处罚权，他不查车内的情况怎么知道超载没有呢？人货混装没有呢？别只想着小车，大货车也在内。对违禁物品是有权查的。如烟花爆竹、易燃易爆、危险品、毒品、烟草等。
有人提出异议，毒品和烟草这些有专门的部门，交警无权查，这就理解错了，交警是警察分工不同，如查获毒品以及烟草之类后，要移交相关人员来进行调查取证。移交了交警就任务完成了。
但是交警要对驾驶员搜身，是无权的，通常交警是叫你拿出驾驶证、行驶证、而且都是驾驶自已拿出来，并没见交警对驾驶员搜身，除非掌握确切证据并有警察同时办案之时才允许。但辅警没有权利。
所以，执勤交警搜查你的车辆内部包括后备箱肯定是在依法执行职务，履行职责，所以完全合理合法！我们作为公民理应积极配合就是了！
这仅仅是个人观点，不对之处警请大家斧正。
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